創(chuàng)新藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)Innovative drug target discovery
技術(shù)平臺(tái)：
在小分子藥物開發(fā)過程中，藥物與靶點(diǎn)蛋白之間的結(jié)合方式對(duì)于理解藥物作用機(jī)制以及指導(dǎo)后續(xù)結(jié)構(gòu)優(yōu)化具有至關(guān)重要的作用。結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù)，如X-ray、cryo-EM和NMR等，已成為確定藥物結(jié)合模型的關(guān)鍵工具。特別是高分辨率的藥物-蛋白共晶結(jié)構(gòu)，為藥物結(jié)構(gòu)優(yōu)化提供了極大的幫助。
然而，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析，尤其是針對(duì)如GPCR、離子通道等膜蛋白靶點(diǎn)，一直是生命科學(xué)研究中的一項(xiàng)艱巨挑戰(zhàn)。這一過程涉及蛋白質(zhì)的表達(dá)純化、藥物與蛋白結(jié)晶條件的篩選、晶體數(shù)據(jù)采集和解析等多個(gè)步驟，不僅耗時(shí)，而且成本高昂。
在細(xì)胞水平，直接研究藥物與靶點(diǎn)蛋白質(zhì)的作用方式，有助于避免蛋白質(zhì)在純化過程中結(jié)構(gòu)的變化以及人工篩選緩沖體系和高濃度藥物-蛋白條件可能帶來的假陽(yáng)性結(jié)果?？平j(luò)思生物致力于提供一站式服務(wù)，運(yùn)用先進(jìn)技術(shù)，解決從細(xì)胞中確定小分子藥物與靶點(diǎn)蛋白相互作用的難題，為客戶的藥物研發(fā)工作提供強(qiáng)大的技術(shù)支持。
科絡(luò)思生物提供化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，利用具有生物活性的光親和化學(xué)探針（其活性與藥物分子相似），在藥物正常使用濃度下，與疾病相關(guān)細(xì)胞或組織進(jìn)行孵育，通過原位快速光交聯(lián)技術(shù)，即可將藥物分子探針與蛋白質(zhì)靶點(diǎn)之間的非共價(jià)作用轉(zhuǎn)化為共價(jià)作用。隨后，通過靶點(diǎn)蛋白質(zhì)富集，酶切釋放非修飾肽段以及選擇性富集藥物分子探針修飾肽段等步驟，結(jié)合高分辨生物大分子質(zhì)譜，即可快速確定肽段信息。最后，結(jié)合分子對(duì)接工具快速得到藥物與靶點(diǎn)蛋白質(zhì)的結(jié)合模型，為后續(xù)的藥物化學(xué)研究提供有力支持。
服務(wù)內(nèi)容：
技術(shù)優(yōu)勢(shì)：
實(shí)驗(yàn)案例：
案例介紹：候選藥物分子B的靶點(diǎn)為多重穿膜蛋白，具有多個(gè)藥物結(jié)合口袋，多次嘗試X-ray和 cryo-EM等結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法，但無法獲得藥物分子與靶點(diǎn)蛋白質(zhì)的結(jié)合模型。
我司根據(jù)候選藥物分子B結(jié)構(gòu)和活性，設(shè)計(jì)并合成了光親和探針Probe B，包括光交聯(lián)基團(tuán)和生物正交基團(tuán)。利用上述的化學(xué)蛋白質(zhì)靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)平臺(tái)，在候選藥物分子B活性相關(guān)的細(xì)胞系中，首先對(duì)靶點(diǎn)蛋白質(zhì)進(jìn)行了驗(yàn)證，之后借助基于質(zhì)譜的非共價(jià)藥物結(jié)合口袋鑒定技術(shù)，確定了藥物結(jié)合口袋空間鄰近肽段，并給出了藥物-蛋白結(jié)合模型。
數(shù)據(jù)展示：免疫印跡顯示，在細(xì)胞中，候選藥物分子B能有效競(jìng)爭(zhēng)探針標(biāo)記信號(hào)，表明候選藥物分子與靶點(diǎn)蛋白質(zhì)直接結(jié)合。
由于化學(xué)探針僅能與空間臨近的肽段，即結(jié)合口袋附近的肽段發(fā)生原位交聯(lián)，借助于串聯(lián)高分辨質(zhì)譜對(duì)探針交聯(lián)肽段進(jìn)行序列鑒定，確定了序列為CLPFIIGCNPTILHVHELYIR.
