背景介紹:
半胱氨酸的巰基因其顯著的反應活性,在蛋白質結構與功能中扮演著關鍵角色。作為親核試劑、氧化還原催化中心、金屬離子配體以及變構效應的關鍵位點,它廣泛參與并深刻影響蛋白質的活性和調控機制。值得注意的是,半胱氨酸殘基易于經歷多種類型的翻譯后修飾過程,這些修飾不僅能夠精密調節(jié)蛋白的功能屬性,也可能導致其功能受損。鑒于此類修飾與人類眾多重大疾病的緊密關聯性,對蛋白質中半胱氨酸上翻譯后修飾組進行定性和定量分析具有至關重要的意義。這對于深入解析相關蛋白質的生物學功能及其在健康和疾病狀態(tài)下的作用機理,具有不可或缺的價值。
科絡思生物在例如半胱氨酸過硫化修飾的鑒定上有著豐富的經驗,創(chuàng)新地利用半胱氨酸通用型探針依據-SH及-SSH pKa的差異,通過調節(jié)pH,降低了大量-SH背景干擾,讓探針更多地標記-SSH,從而實現對巰基化位點的有效鑒定。
科絡思生物具備先進的質譜技術,能夠直接且精確地解析多種類型的蛋白質翻譯后修飾及其發(fā)生的具體位點。通過巧妙結合分離富集技術和同位素標記等先進手段,可以實現對各類修飾的大規(guī)模、高通量定性和定量分析,為深入研究蛋白質翻譯后修飾提供了強有力的技術支撐。
技術平臺:
我們的優(yōu)勢:
1.專業(yè)技術優(yōu)勢:團隊經驗豐富,頂級期刊發(fā)表,提供業(yè)界權威技術服務,個性化方案,保障最佳實驗效果。
2.嚴謹質量管理:成熟質量管理體系,遵循ISO9001標準,確保報告真實可信。
3.一站式服務:覆蓋探針設計、合成、靶點發(fā)現、生信分析全流程,咨詢到交付一站式,及時反饋進度,保證客戶滿意度。
4.高性能設備:配備Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480、Thermo Flsher Q Exactlve HF-X、Bruker timsTOF等先進質譜儀,助力科研突破。
我們的服務:
項目名稱 |
半胱氨酸翻譯后修飾蛋白質組學分析 |
樣品形式 |
純蛋白、細胞裂解液、活細胞、疾病組織、血液、細菌、植物組織 |
硬件平臺 |
Non-contact ultrasonic cell pulverizer,ChemiDoc MP Imaging System,Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 mass spectrometer |
項目周期 |
4-8周 |
交付內容 |
項目報告(包含實驗流程,數據分析圖表,生信分析結果等) |
價格 |
咨詢 |
代表性修飾:
領域 |
翻譯后修飾 |
炎癥 |
衣康酸化、S-羰基化、S-亞硝基化 |
代謝 |
衣康酸化、S-羰基化、S-琥珀?;?、S-豆蔻?;?、S-棕櫚?;?、S-亞硝基化、S-過硫化 |
傳染 |
衣康酸化 |
神經 |
衣康酸化、S-羰基化、S-琥珀?;?、S-豆蔻?;?、S-棕櫚酰化、S-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化、S-次磺酸化、S-過硫化 |
氧化 |
S-羰基化、S-琥珀?;-次磺酸化、S-過硫化 |
免疫 |
衣康酸化、S-羰基化、S-棕櫚?;?、S-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化、S-次磺酸化 |
細胞 |
S-羰基化、S-琥珀?;?、S-豆蔻?;-棕櫚?;-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化、S-次磺酸化、S-過硫化 |
癌癥 |
S-棕櫚?;-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化、S-次磺酸化、S-過硫化 |
病毒與疾病 |
衣康酸化、S-羰基化、S-琥珀酰化、S-豆蔻?;?、S-棕櫚酰化、S-亞硝基化、S-次磺酸化、S-過硫化 |
心血管 |
S-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化、S-過硫化 |
植物 |
S-異戊二烯化(含法尼基化/香葉基香葉基化)、S-亞硝基化 |
案例展示:
1.棕櫚?;?/strong>
棕櫚?;揎検巧矬w內一種重要的蛋白質修飾方式,它利用16碳的棕櫚酸通過硫酯鍵與蛋白質的半胱氨酸殘基結合,在調控蛋白質的轉運、細胞定位和穩(wěn)定性等方面發(fā)揮關鍵作用。將細胞裂解、還原并封閉裸露的半胱氨酸后,再經過羥胺處理與特異性的半胱氨酸探針標記,將棕櫚?;揎椫脫Q,再經過酶切、富集等步驟,確定棕櫚?;揎椢稽c。
棕櫚?;鞒虉D
棕櫚?;瘜嶒灁祿D
2.次磺酸化
次磺酸化修飾,作為一種廣泛存在的蛋白質修飾類型,它能夠調整蛋白質的三維構象穩(wěn)定性、活性表達以及與其他分子間的相互作用網絡,在信號傳導、酶活性調節(jié)、維護細胞內部環(huán)境穩(wěn)定等過程發(fā)揮重要作用。將次磺酸化探針WYneN標記的細胞(活細胞水平)進行裂解,隨后經Click反應、富集、酶切、位點切割等步驟,確定WYneN探針標記的次磺酸化修飾位點。
次磺酸化探針與流程圖
次磺酸化實驗數據圖
2.巰基化
巰基化指蛋白質的半胱氨酸殘基上偶聯了過硫酸基團(-SSH),此過程由硫化氫(H2S)介導。為了深入研究這一過程,可以從細胞或組織樣本中提取全蛋白質組,采用化學探針標記法(半胱氨酸特異型探針)。這種方法區(qū)別于巰基干擾,通過精確調整pH值實現對硫巰基的有效標記。隨后,利用高分辨質譜技術,研究人員能夠精確地發(fā)現硫巰基化的位點,從而進一步揭示該翻譯后修飾在生物體內的重要作用。
利用HeLa細胞模型,首先提取其全蛋白質組。隨后,通過NaHS造模并調節(jié)pH值,使半胱氨酸通用探針能夠準確標記硫巰基。經過富集、酶解和質譜檢測等一系列步驟,鑒定到180個含有-SSH修飾的肽段,120個相關蛋白,包括已報道的巰基化位點, GAPDH_C152和C247。
以下展示帶有-SSH修飾的肽段二級譜圖: